Pochodził z rodziny żydowskiej, urodził się jako syn Gerszona Zysmana i Łai Przysucherów w 1861 r. w Płocku. Uczył się w gimnazjum w Płocku, a w 1887 ukończył studia na Wydziale Medycyny Cesarskiego Uniwersytetu Warszawskiego (dyplom otrzymał 8 grudnia 1887). W 1889 przeszedł w Warszawie na Luteranizm.

Najpierw praktykował w Wisznicach, od 1890 w Warszawie, a w 1891 osiedlił się w Klimontowie. Zaangarzował się w działalność spolęczną - leczył za darmo biednych mieszkańców Klimontowa i okolic, organizował dla nich pomoc finansową. przyczynił się też do powstania w tej miejscowości kasy oszczędnościowo - pożyczkowej, placówki pocztowej, także telegrafu, jeszcze za życia był okreslany ,, Klimontowskim - Judymem,,

Po wybuchu I wojny światowej w 1914, mimo poważnej choroby - gruźlicy kości - powołano go do rosyjskiego wojska i wraz z rodziną przeniesiony do Moskwy. zysman służył jako lekarz wojskowy m.in. w szpitalu wojskowym w Jagotinie. Do Klimontowa powrócił w 1918, pracował i mieszkał w miejcowym szpitalu.

Zmarł w 1926 w Klimontów. W ceremoni pogrzebowej, po za pastorem z Sielca Kazimierzem Szeferem, uczestniczył rabin i biskup sandomierski.

Jakub Zysman był żonaty z polską szlachcianką, Eufemią Modzelewską, mieli trujkę dzieci: Jerzego, Irenę oraz Wiktora, poetę futurystę, znanego pod pseudonimem Bruno Jasieński.

Zostawił po sobie pamięć dobrego człowieka i zasłużonego dla społeczeństwa Polaka, wielkiego społeczmika i filantropa. Do dzisiaj trwa pamięć o nim wśród mieszkańców Klimontowa,  jest patronem jednej z ulic w Klimontowie.