В 1940 г. в Москве была арестована жена Яна Калнберзина (Янис Калнберзиньш) - Илга Петровна, которая спустя два года после длительных пыток, допросов скончалась (фактически убита) в Бутырской тюрьме, Москва.

Троих детей, старшему из которых шел девятый год, а младшему полтора года, отправили в детские дома.

Сам Ян Калнберзин был выпущен на свободу с установлением в Латвии советской власти в 1940 г. и сразу же стал первым секретарем ЦК Компартии Латвии, одновременно в 1940 — 1950 гг. был первым секретарем Рижского горкома партии.

С 27 ноября 1959 по 5 мая 1970 года – Председатель Президиума Верховного Совета Латвийской ССР.

С большим трудом разыскал детей. Где могила жены, ему не сказали. Но продолжил служить кровавому режиму и губить судьбы других граждан Латвии.