Ефим Давидович Немцов, по одним данным в 1960-х годах "занимал пост начальника строительно-монтажного управления крупнейшего городского объединения Главсочипедстрой", а в дальнейшем работал на высокой должности в профильном министерстве [159]. По другой информации, отец Бориса Немцова был начальником главка в Министерстве нефтяной и газовой промышленности (упоминался также как "замминистра советского нефтегазового комплекса") - по сведениям СМИ, работал вместе с будущим премьер-министром России Виктором Черномырдиным. Борису еще не исполнилось и восьми лет, когда его родители развелись, и его мать, детский врач Дина Яковлевна Эйдман вместе с сыном и дочерью Юлией переехала в Горький (Нижний Новгород).

По некоторым сведениям, продолжал Немцов и общаться с отцом, который помогал бывшей семье материально и часто забирал Бориса к себе в Москву. Упоминалось, что Немцов был дружен со своим сводным младшим братом Юрием (по данным на 1998 год - бизнесменом).