Pirmoji bažnyčia pastatyta apie 1714 m. (tais metais Žagarės klebonas prašė Šiaulių ekonomo lentelių Skaistgirio bažnyčios stogui uždengti). Bažnyčia 1819 m. buvo uždaryta, nes galėjo sugriūti. Nauja (dabartinė) bažnyčia iš plūkto molio pastatyta 1827 m. (pirmosios pamaldos įvyko 1827 m. rugpjūčio 24 d.).

Skaistgirys nuo seno garsėjo Šv. Jurgio (pavasarį) ir Šv. Martyno (rudenį) atlaidais. Nuo 1836 m. čia nuolat gyveno kunigas. 1905 m. įsteigta parapija.

Architektūra

Bažnyčia neorenesansinė, stačiakampio plano, vienabokštė, su trisiene apside. Vienanavė. Joje 3 altoriai. Šventoriaus tvora mūrinė, su stulpiniais vartais. Jame yra medinės Kryžiaus kelio stočių koplytėlės.

Didžiajame altoriuje yra bažnyčios globėjo Šv. Jurgio paveikslas (XIX a.), šoniniame altoriuje – kito globėjo, Šv. Martyno paveikslas (XIX a.).